超强台风“摩羯”的来袭，对海南水产养殖业造成了严重的影响。台风会导致养殖鱼类相互碰撞，体表极易擦伤，继发感染细菌、寄生虫等病害，加上养殖水环境突变，养殖对象产生应激反应，免疫能力下降，养殖水域或体内的有害细菌、病毒就可能趁虚而入，引发病害流行暴发。

为应对台风灾害后的水产养殖病害，9月11日，生物所“一所对一县”科技救灾服务队赴定安、琼海等地开展灾后科技服务，提醒水产养殖户提高灾后病害防控意识，积极做好病害防治工作。

在琼海市蓝澳水产育苗厂，该基地共有池塘及育苗池160多亩，拥有种虾1万多斤。台风造成部分大棚损坏、水质恶化，为保障种虾和虾苗的存活，以及后续的生产恢复，专家针对风后抗应激、疫病防控、饲料投喂和水质调控等给予了建议和指导。

在定安县龙湖镇稻虾养殖基地，该基地共种植水稻40多亩，已投放红螯螯虾虾苗9万多尾。台风造成排水渠倒灌，稻田堤坝部分严重坍塌，专家推测大部分虾苗已外逃，为保障剩余虾苗的养殖成功，以及后续的生产恢复，针对风后抗应激、疫病防控、饲料投喂和水质调控等给予了建议和指导。